Thanks,<br>Hopefully I&#39;ll debrief with people before tomorrow meeting.<br><br><div class="gmail_quote">On Thu, Dec 3, 2009 at 2:17 PM, Marlon Pierce <span dir="ltr">&lt;<a href="mailto:mpierce@cs.indiana.edu">mpierce@cs.indiana.edu</a>&gt;</span> wrote:<br>
<blockquote class="gmail_quote" style="border-left: 1px solid rgb(204, 204, 204); margin: 0pt 0pt 0pt 0.8ex; padding-left: 1ex;">



<div bgcolor="#ffffff" text="#000000">
I&#39;m not sure this made it through, so I&#39;m posting again.  Additional
note: the only tool we have found that can do the ORE GRDDL transforms
is Saxon.  Foresite (both Java and Python versions) and Jena didn&#39;t
work.  Li Na&#39;s feeds worked for us without modification using Saxon.
The others required some modifications. <br>
<br>
Original XML attachments bounced, so here are links to them (hopefully
public):<br>
<br>
Modified Article Atom:
<a href="https://www.slashtmp.iu.edu/public/download.php?FILE=marpierc/60769zzUwGE" target="_blank">https://www.slashtmp.iu.edu/public/download.php?FILE=marpierc/60769zzUwGE</a><br>
<br>
Modified CrystalEye Atom:
<a href="https://www.slashtmp.iu.edu/public/download.php?FILE=marpierc/63985LbH743" target="_blank">https://www.slashtmp.iu.edu/public/download.php?FILE=marpierc/63985LbH743</a><br>
<br>
<br>
<br>
Marlon<br>
<br>
<br>
-------- Original Message --------
<table border="0" cellpadding="0" cellspacing="0">
  <tbody>
    <tr>
      <th align="right" valign="baseline" nowrap>Subject: </th>
      <td>orechem-article, Crystal-Eye atom feeds validation</td>
    </tr>
    <tr>
      <th align="right" valign="baseline" nowrap>Date: </th>
      <td>Wed, 2 Dec 2009 10:21:06 -0600</td>
    </tr>
    <tr>
      <th align="right" valign="baseline" nowrap>From: </th>
      <td>Rameswara Sashi Kiran Challa <a href="mailto:schalla@umail.iu.edu" target="_blank">&lt;schalla@umail.iu.edu&gt;</a></td>
    </tr>
    <tr>
      <th align="right" valign="baseline" nowrap>To: </th>
      <td>Marlon Pierce <a href="mailto:mpierce@cs.indiana.edu" target="_blank">&lt;mpierce@cs.indiana.edu&gt;</a></td>
    </tr>
  </tbody>
</table>
<br>
<br>
Hi all,<br>
We validated the two Atom feeds that we have now with the <a href="http://feedvalidator.org/" target="_blank">Feed
Validator</a> and the <a href="http://african.lanl.gov/ovalnet/validate.jsp" target="_blank">ORE
Atom Resource Map Validator</a>. These validators were mentioned in the
Open Archives&#39; &quot;<a href="http://www.openarchives.org/ore/1.0/tools" target="_blank">Tools and Additional
Resources</a>&quot; document.<br>
The modified feeds are attached below. The following are the
modifications done:<br>
<br>
1) orechem-article-atom <br>
   According to the Feed Validator made small corrections in typos and
the syntax of the &lt;atom:id&gt; and &lt;atom:updated&gt;  tags.<br>
   According to the ORE Atom Resource Map Validator and looking into
the &quot;<a href="http://www.openarchives.org/ore/1.0/atom" target="_blank">ORE User
Guide-Resource Map Implementation in Atom</a>&quot; document added two
&lt;atom:category&gt; tags. <br>
<br>
2)Crystal-Eye feed<br>
  According to the Feed validator, made corrections in typos and the
syntax of &lt;atom:id&gt; tags. For the sake of validation just used
one of the valid id tag&#39;s value present in the feed for all other
&lt;atom:id&gt; tags.<br>
 The ORE Atom Resource Map Validator gave a lot of errors. So haven&#39;t
made any changes according to that.<br>
<br>
Please take a look into these.<br>
<br>
Thanks<br>
Regards<br>
Sashikiran<br>
   <br>
<br>
<br clear="all">
<br>
-- <br>
Sashikiran Challa<br>
MS Cheminformatics,<br>
School of Informatics and Computing,<br>
Indiana University, Bloomington,IN<br>
<a href="mailto:schalla@indiana.edu" target="_blank">schalla@indiana.edu</a><br>
812-606-3254<br>
<br>
</div>


<br>_______________________________________________<br>
Orechem mailing list<br>
<a href="mailto:Orechem@openarchives.org">Orechem@openarchives.org</a><br>
<a href="http://www.openarchives.org/mailman/listinfo/orechem" target="_blank">http://www.openarchives.org/mailman/listinfo/orechem</a><br>
<br></blockquote></div><br><br clear="all"><br>-- <br>Peter Murray-Rust<br>Reader in Molecular Informatics<br>Unilever Centre, Dep. Of Chemistry<br>University of Cambridge<br>CB2 1EW, UK<br>+44-1223-763069<br>